Therna Biosciences представила RNA-Logix, ИИ-платформу для изучения РНК и поиска кандидатов в лекарства

Модель BioReason-RNA по последовательности РНК строит пошаговое объяснение того, как молекула может работать в клетке, и выдаёт гипотезы, которые можно проверить в лаборатории. Платформа RNA-Logix опирается на собственную базу экспериментов Therna: по данным компании, она содержит десятки миллионов измерений по сотням тысяч синтетических конструкций и охватывает несколько клеточных контекстов.

RNA-Logix объединяет РНК-базовые модели Therna, собственные экспериментальные данные и ИИ-учёного, который выбирает подходящие инструменты, рассуждает о молекулярных механизмах болезни и проверяет предложенные гипотезы по данным. Если доказательства противоречат объяснению, платформа пересматривает его. Компания также использует этот цикл проверки для дообучения базовых моделей методом обучения с подкреплением.

Что умеет платформа

Платформа применима как к РНК в роли лекарства, так и к РНК в роли мишени. Её возможности охватывают мРНК, антисмысловые олигонуклеотиды и малые интерферирующие РНК.

По словам Хани Гударзи, научного соучредителя Therna, модель выстраивает причинную цепочку гипотез от последовательности через молекулярный механизм к последствиям для больных клеток. Каждое звено можно проверить по данным компании.

Инструменты NVIDIA и доступ

Помимо BioReason-RNA, платформа использует CodonFM, открытую модель BioNeMo для дизайна РНК, пакет rapids-singlecell для анализа одиночных клеток, разработанный совместно с scverse, и NVIDIA Parabricks для геномного анализа.

Therna откроет доступ к BioReason-RNA на размещённых платформах для исследователей и индустриальных партнёров. Остальные РНК-базовые модели компании и наборы данных Chronos остаются для внутренних программ и партнёрских проектов. Значение разработки компания видит в том, что ИИ-инструменты всё глубже встраиваются в доклиническую стадию создания лекарств, где решающим остаётся качество собственных данных.